Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bcas2Q9D287 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms