Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1lQ9D1E5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms