Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Susd3Q9D176 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd3Q9D176 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms