Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lsm12Q9D0R8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsm12Q9D0R8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms