Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pbdc1Q9D0B6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms