Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mdm1Q9D067 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mdm1Q9D067 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms