Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Thumpd2Q9CZB3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Thumpd2Q9CZB3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms