Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ube2fQ9CY34 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ube2fQ9CY34 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ube2fQ9CY34 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ube2fQ9CY34 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2fQ9CY34 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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