Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx7Q9CY18 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms