Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Xrcc3Q9CXE6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc3Q9CXE6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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