Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mgme1Q9CXC3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mgme1Q9CXC3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms