Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Utp23Q9CX11 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Utp23Q9CX11 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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