Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn1Q9CWM4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pfdn1Q9CWM4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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