Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Sycp2Q9CUU3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sycp2Q9CUU3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sycp2Q9CUU3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms