Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sppl3Q9CUS9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms