Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930553M12RikQ9CUH1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms