Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otud1Q9CUB6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms