Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp13a2Q9CTG6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a2Q9CTG6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms