Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prps2Q9CS42 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prps2Q9CS42 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prps2Q9CS42 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prps2Q9CS42 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prps2Q9CS42 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prps2Q9CS42 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prps2Q9CS42 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prps2Q9CS42 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prps2Q9CS42 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prps2Q9CS42 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Prps2Q9CS42 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Prps2Q9CS42 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Prps2Q9CS42 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prps2Q9CS42 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms