Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Atg12Q9CQY1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms