Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PompQ9CQT5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms