Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Riok2Q9CQS5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riok2Q9CQS5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms