Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc2Q9CQP2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms