Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL5

Mrpl18, 39S ribosomal protein L18, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl18Q9CQL5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl18Q9CQL5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl18Q9CQL5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl18Q9CQL5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl18Q9CQL5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl18Q9CQL5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl18Q9CQL5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl18Q9CQL5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl18Q9CQL5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl18Q9CQL5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl18Q9CQL5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl18Q9CQL5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl18Q9CQL5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl18Q9CQL5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl18Q9CQL5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl18Q9CQL5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl18Q9CQL5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl18Q9CQL5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl18Q9CQL5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl18Q9CQL5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl18Q9CQL5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl18Q9CQL5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Mrpl18Q9CQL5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Mrpl18Q9CQL5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Mrpl18Q9CQL5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Mrpl18Q9CQL5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Mrpl18Q9CQL5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl18Q9CQL5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Mrpl18Q9CQL5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Mrpl18Q9CQL5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms