Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snrpb2Q9CQI7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms