Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med4Q9CQA5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med4Q9CQA5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms