Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb3bpQ9CQ82 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms