Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700129C05RikQ9CQ77 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms