Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pkp2Q9CQ73 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms