Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms