Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NenfQ9CQ45 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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NenfQ9CQ45 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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NenfQ9CQ45 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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NenfQ9CQ45 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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NenfQ9CQ45 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NenfQ9CQ45 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.1 ms