Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl17Q9CPR4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms