Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cox6cQ9CPQ1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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