Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt23Q99PS0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms