Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gtf2a1Q99PM3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2a1Q99PM3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms