Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim8Q99PJ2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms