Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GpnmbQ99P91 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms