Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf2ird2Q99NI3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms