Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep41Q99NF3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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