Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sf3b1Q99NB9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms