Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Acss1Q99NB1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms