Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tdrd1Q99MV1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms