Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mccc1Q99MR8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mccc1Q99MR8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms