Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtprtQ99M80 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprtQ99M80 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms