Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Abcf2Q99LE6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms