Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nmd3Q99L48 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nmd3Q99L48 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms