Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pagr1aQ99L02 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pagr1aQ99L02 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms