Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TriobpQ99KW3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms