Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99KU6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99KU6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99KU6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99KU6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99KU6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99KU6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99KU6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99KU6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99KU6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99KU6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99KU6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99KU6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99KU6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99KU6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99KU6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99KU6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99KU6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99KU6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99KU6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99KU6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q99KU6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q99KU6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q99KU6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q99KU6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q99KU6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Q99KU6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q99KU6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q99KU6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q99KU6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q99KU6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99KU6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99KU6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99KU6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99KU6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99KU6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99KU6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99KU6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99KU6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99KU6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99KU6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99KU6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99KU6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99KU6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99KU6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99KU6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99KU6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99KU6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99KU6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99KU6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q99KU6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99KU6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99KU6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99KU6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99KU6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99KU6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99KU6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99KU6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99KU6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99KU6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99KU6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99KU6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99KU6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99KU6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99KU6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99KU6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99KU6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99KU6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99KU6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99KU6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q99KU6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99KU6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99KU6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99KU6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99KU6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99KU6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99KU6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99KU6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99KU6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99KU6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99KU6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99KU6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99KU6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99KU6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99KU6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99KU6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99KU6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99KU6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99KU6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99KU6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99KU6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99KU6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99KU6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99KU6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q99KU6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99KU6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99KU6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99KU6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99KU6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q99KU6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms