Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clint1Q99KN9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms